MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans K601 chromosome

Total Repeats: 129174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015422	AGC	2	6	167513	167518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822801
4502	NC_015422	CGG	2	6	167553	167558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822801
4503	NC_015422	CAG	2	6	167641	167646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822801
4504	NC_015422	CTT	2	6	167656	167661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822801
4505	NC_015422	GC	3	6	167755	167760	0 %	0 %	50 %	50 %	330822801
4506	NC_015422	GGC	2	6	167761	167766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822801
4507	NC_015422	GCT	2	6	167838	167843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822801
4508	NC_015422	TGC	2	6	167868	167873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822801
4509	NC_015422	CGA	2	6	167893	167898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822801
4510	NC_015422	CG	4	8	167925	167932	0 %	0 %	50 %	50 %	330822801
4511	NC_015422	CGC	2	6	167937	167942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822801
4512	NC_015422	TGA	2	6	167961	167966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822801
4513	NC_015422	CG	4	8	167967	167974	0 %	0 %	50 %	50 %	330822801
4514	NC_015422	GCG	2	6	168008	168013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822801
4515	NC_015422	CGAG	2	8	168024	168031	25 %	0 %	50 %	25 %	330822801
4516	NC_015422	ACG	2	6	168032	168037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822801
4517	NC_015422	GGGGC	2	10	168052	168061	0 %	0 %	80 %	20 %	330822801
4518	NC_015422	CGT	2	6	168184	168189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822802
4519	NC_015422	CGAAGC	2	12	168199	168210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822802
4520	NC_015422	GCAG	2	8	168223	168230	25 %	0 %	50 %	25 %	330822802
4521	NC_015422	GGC	2	6	168236	168241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822802
4522	NC_015422	GC	3	6	168286	168291	0 %	0 %	50 %	50 %	330822802
4523	NC_015422	CCTCGA	2	12	168349	168360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330822802
4524	NC_015422	GGC	2	6	168409	168414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822802
4525	NC_015422	CGG	2	6	168484	168489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822802
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4528	NC_015422	CCA	2	6	168670	168675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822802
4529	NC_015422	GCG	2	6	168718	168723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822802
4530	NC_015422	GC	3	6	168728	168733	0 %	0 %	50 %	50 %	330822802
4531	NC_015422	CAG	2	6	168734	168739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822802
4532	NC_015422	ATC	2	6	168741	168746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822802
4533	NC_015422	TGC	2	6	168756	168761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822802
4534	NC_015422	CTT	2	6	168809	168814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822802
4535	NC_015422	TGG	2	6	168835	168840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822802
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4537	NC_015422	CGC	2	6	168892	168897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822802
4538	NC_015422	GCA	2	6	168946	168951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822802
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4542	NC_015422	CAGGCC	2	12	169040	169051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	330822802
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4544	NC_015422	GCC	2	6	169080	169085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822802
4545	NC_015422	CGA	2	6	169111	169116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822802
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4547	NC_015422	TCG	2	6	169161	169166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822802
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4549	NC_015422	GTT	2	6	169214	169219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330822802
4550	NC_015422	TGG	2	6	169240	169245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822802
4551	NC_015422	CGG	2	6	169391	169396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822803
4552	NC_015422	GCC	2	6	169462	169467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822803
4553	NC_015422	GC	3	6	169472	169477	0 %	0 %	50 %	50 %	330822803
4554	NC_015422	GCA	2	6	169493	169498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4555	NC_015422	CAG	3	9	169503	169511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4556	NC_015422	CAG	2	6	169626	169631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4557	NC_015422	CGT	2	6	169634	169639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4558	NC_015422	GC	3	6	169651	169656	0 %	0 %	50 %	50 %	330822803
4559	NC_015422	CTG	2	6	169665	169670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4560	NC_015422	GCG	2	6	169679	169684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822803
4561	NC_015422	GCG	4	12	169691	169702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822803
4562	NC_015422	GGCCG	2	10	169714	169723	0 %	0 %	60 %	40 %	330822803
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4564	NC_015422	CCA	2	6	169790	169795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822803
4565	NC_015422	CAG	2	6	169803	169808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4566	NC_015422	CGGC	2	8	169819	169826	0 %	0 %	50 %	50 %	330822803
4567	NC_015422	TCG	2	6	169847	169852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822803
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4569	NC_015422	CTG	2	6	169866	169871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822803
4570	NC_015422	AGGCG	2	10	169901	169910	20 %	0 %	60 %	20 %	330822803
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4579	NC_015422	GAGC	2	8	170162	170169	25 %	0 %	50 %	25 %	330822803
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4587	NC_015422	GGT	2	6	170559	170564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822804
4588	NC_015422	GAG	2	6	170566	170571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822804
4589	NC_015422	CGC	2	6	170577	170582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822804
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4591	NC_015422	CGGC	2	8	170630	170637	0 %	0 %	50 %	50 %	330822804
4592	NC_015422	GC	3	6	170651	170656	0 %	0 %	50 %	50 %	330822804
4593	NC_015422	CAA	2	6	170688	170693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822804
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4595	NC_015422	CTA	2	6	170778	170783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822804
4596	NC_015422	GC	4	8	170788	170795	0 %	0 %	50 %	50 %	330822804
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4599	NC_015422	GGCCA	2	10	170875	170884	20 %	0 %	40 %	40 %	330822804
4600	NC_015422	TGG	2	6	170909	170914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822804
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4602	NC_015422	GC	3	6	171034	171039	0 %	0 %	50 %	50 %	330822804
4603	NC_015422	CAG	2	6	171052	171057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822804
4604	NC_015422	CAA	2	6	171066	171071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822804
4605	NC_015422	CGC	2	6	171077	171082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822804
4606	NC_015422	CTG	2	6	171094	171099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822804
4607	NC_015422	CGC	2	6	171105	171110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822804
4608	NC_015422	CAA	2	6	171144	171149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822804
4609	NC_015422	AGCC	2	8	171166	171173	25 %	0 %	25 %	50 %	330822804
4610	NC_015422	AGC	2	6	171253	171258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822804
4611	NC_015422	GAA	2	6	171336	171341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822805
4612	NC_015422	CGG	2	6	171434	171439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822805
4613	NC_015422	CGG	2	6	171468	171473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822805
4614	NC_015422	GC	3	6	171477	171482	0 %	0 %	50 %	50 %	330822805
4615	NC_015422	GTG	2	6	171499	171504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822805
4616	NC_015422	GC	3	6	171526	171531	0 %	0 %	50 %	50 %	330822805
4617	NC_015422	AGC	2	6	171575	171580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822805
4618	NC_015422	GCCG	2	8	171603	171610	0 %	0 %	50 %	50 %	330822805
4619	NC_015422	CACC	2	8	171639	171646	25 %	0 %	0 %	75 %	330822805
4620	NC_015422	GCT	2	6	171693	171698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822805
4621	NC_015422	CTG	2	6	171718	171723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822805
4622	NC_015422	GCA	2	6	171732	171737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822805
4623	NC_015422	CGG	2	6	171759	171764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822805
4624	NC_015422	CAGC	2	8	171768	171775	25 %	0 %	25 %	50 %	330822805
4625	NC_015422	CGG	3	9	171777	171785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822805
4626	NC_015422	CCAGC	2	10	171786	171795	20 %	0 %	20 %	60 %	330822805
4627	NC_015422	CG	3	6	171835	171840	0 %	0 %	50 %	50 %	330822805
4628	NC_015422	GGC	2	6	171876	171881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822805
4629	NC_015422	GCT	2	6	171882	171887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822805
4630	NC_015422	GC	3	6	171937	171942	0 %	0 %	50 %	50 %	330822805
4631	NC_015422	TGG	2	6	171992	171997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822805
4632	NC_015422	TGC	2	6	172007	172012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822805
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4634	NC_015422	TCGCC	2	10	172064	172073	0 %	20 %	20 %	60 %	330822805
4635	NC_015422	GC	5	10	172143	172152	0 %	0 %	50 %	50 %	330822805
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4642	NC_015422	GCG	2	6	172479	172484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822806
4643	NC_015422	CGC	2	6	172594	172599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822806
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4646	NC_015422	CTG	2	6	172733	172738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822806
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4657	NC_015422	GGCCA	2	10	172988	172997	20 %	0 %	40 %	40 %	330822806
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4664	NC_015422	CGC	2	6	173378	173383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822807
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4721	NC_015422	GAT	2	6	175052	175057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822808
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4733	NC_015422	GCCA	2	8	175320	175327	25 %	0 %	25 %	50 %	330822808
4734	NC_015422	GCC	2	6	175344	175349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822808
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4736	NC_015422	GCCG	2	8	175463	175470	0 %	0 %	50 %	50 %	330822808
4737	NC_015422	AAG	2	6	175473	175478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822808
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4740	NC_015422	CGA	2	6	175505	175510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822808
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4742	NC_015422	GCT	2	6	175679	175684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822808
4743	NC_015422	CGG	3	9	175736	175744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822808
4744	NC_015422	CGG	2	6	175756	175761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822808
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4756	NC_015422	TGC	2	6	176076	176081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822809
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4824	NC_015422	CTG	3	9	178762	178770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822811
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4826	NC_015422	CTG	2	6	178858	178863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822811
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4843	NC_015422	GCT	2	6	179435	179440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822812
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4849	NC_015422	CGG	2	6	179638	179643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822812
4850	NC_015422	TCG	2	6	179652	179657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822812
4851	NC_015422	ACGG	2	8	179687	179694	25 %	0 %	50 %	25 %	330822812
4852	NC_015422	GCA	2	6	179705	179710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822812
4853	NC_015422	GGGC	2	8	179753	179760	0 %	0 %	75 %	25 %	330822812
4854	NC_015422	TCA	2	6	179803	179808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822812
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4857	NC_015422	AGG	2	6	179986	179991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822812
4858	NC_015422	GAAGA	2	10	180087	180096	60 %	0 %	40 %	0 %	330822812
4859	NC_015422	GCC	2	6	180186	180191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822813
4860	NC_015422	AGCC	2	8	180214	180221	25 %	0 %	25 %	50 %	330822813
4861	NC_015422	TTC	2	6	180228	180233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822813
4862	NC_015422	CCGCG	2	10	180234	180243	0 %	0 %	40 %	60 %	330822813
4863	NC_015422	GGC	3	9	180246	180254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4864	NC_015422	CCA	2	6	180344	180349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822813
4865	NC_015422	GGC	2	6	180387	180392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4866	NC_015422	GCG	2	6	180434	180439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4867	NC_015422	GC	3	6	180446	180451	0 %	0 %	50 %	50 %	330822813
4868	NC_015422	GTG	2	6	180495	180500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822813
4869	NC_015422	CAG	2	6	180501	180506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822813
4870	NC_015422	CG	3	6	180524	180529	0 %	0 %	50 %	50 %	330822813
4871	NC_015422	GC	3	6	180552	180557	0 %	0 %	50 %	50 %	330822813
4872	NC_015422	GCG	2	6	180618	180623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4873	NC_015422	CGT	2	6	180656	180661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822813
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4875	NC_015422	TCG	2	6	180676	180681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822813
4876	NC_015422	CCG	3	9	180824	180832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822813
4877	NC_015422	CGA	2	6	180857	180862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822813
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4879	NC_015422	CAC	2	6	180894	180899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822813
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4882	NC_015422	CGG	2	6	180929	180934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4883	NC_015422	TTC	2	6	180942	180947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330822813
4884	NC_015422	CG	3	6	180960	180965	0 %	0 %	50 %	50 %	330822813
4885	NC_015422	CGG	2	6	180971	180976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4886	NC_015422	GTC	2	6	180993	180998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822813
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4888	NC_015422	GCG	2	6	181005	181010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822813
4889	NC_015422	CTGCC	2	10	181015	181024	0 %	20 %	20 %	60 %	330822813
4890	NC_015422	GA	3	6	181064	181069	50 %	0 %	50 %	0 %	330822813
4891	NC_015422	GCC	2	6	181225	181230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822814
4892	NC_015422	CATGCC	2	12	181252	181263	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	330822814
4893	NC_015422	GTG	2	6	181297	181302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822814
4894	NC_015422	CGG	2	6	181314	181319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822814
4895	NC_015422	GCC	2	6	181337	181342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822814
4896	NC_015422	ACA	2	6	181391	181396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822814
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4898	NC_015422	CGG	2	6	181407	181412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822814
4899	NC_015422	TCG	2	6	181430	181435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822814
4900	NC_015422	TCG	2	6	181463	181468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822814
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4902	NC_015422	GTG	2	6	181489	181494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822814
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4909	NC_015422	TGGCCG	2	12	181859	181870	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	330822814
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4929	NC_015422	CG	3	6	182475	182480	0 %	0 %	50 %	50 %	330822815
4930	NC_015422	ACG	2	6	182506	182511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822815
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4934	NC_015422	GAG	2	6	182601	182606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330822815
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4949	NC_015422	GC	3	6	182918	182923	0 %	0 %	50 %	50 %	330822815
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4953	NC_015422	CG	4	8	183058	183065	0 %	0 %	50 %	50 %	330822815
4954	NC_015422	CGC	2	6	183125	183130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822815
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4959	NC_015422	CACC	2	8	183555	183562	25 %	0 %	0 %	75 %	330822816
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4968	NC_015422	TGG	2	6	183741	183746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822816
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4972	NC_015422	CACCAT	2	12	183838	183849	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330822816
4973	NC_015422	TGA	2	6	183861	183866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822816
4974	NC_015422	CTA	2	6	183922	183927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822816
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4978	NC_015422	CGGC	2	8	184023	184030	0 %	0 %	50 %	50 %	330822816
4979	NC_015422	GGC	2	6	184034	184039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822816
4980	NC_015422	ACC	2	6	184044	184049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822816
4981	NC_015422	CGG	2	6	184138	184143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822816
4982	NC_015422	ATG	2	6	184154	184159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330822816
4983	NC_015422	CAT	2	6	184165	184170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330822816
4984	NC_015422	GC	3	6	184207	184212	0 %	0 %	50 %	50 %	330822816
4985	NC_015422	GGC	2	6	184307	184312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330822816
4986	NC_015422	TGG	2	6	184353	184358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330822816
4987	NC_015422	CAA	2	6	184366	184371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330822816
4988	NC_015422	GCC	2	6	184382	184387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330822816
4989	NC_015422	GAA	2	6	184405	184410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330822816
4990	NC_015422	ACG	2	6	184431	184436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330822816
4991	NC_015422	GC	3	6	184468	184473	0 %	0 %	50 %	50 %	330822816
4992	NC_015422	GCGCA	2	10	184533	184542	20 %	0 %	40 %	40 %	330822817
4993	NC_015422	CCA	2	6	184544	184549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330822817
4994	NC_015422	CTG	2	6	184551	184556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330822817
4995	NC_015422	GCTG	2	8	184561	184568	0 %	25 %	50 %	25 %	330822817
4996	NC_015422	CCTG	2	8	184598	184605	0 %	25 %	25 %	50 %	330822817
4997	NC_015422	GC	3	6	184636	184641	0 %	0 %	50 %	50 %	330822817
4998	NC_015422	GGCCGA	2	12	184652	184663	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330822817
4999	NC_015422	GC	3	6	184667	184672	0 %	0 %	50 %	50 %	330822817
5000	NC_015422	GC	3	6	184682	184687	0 %	0 %	50 %	50 %	330822817

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